萨斯喀彻温大学健康科学理学硕士是一项预计两年完成、在萨斯卡通面授的论文型研究学位，面向在医学院临床系或物理治疗学院开展研究的学生。项目聚焦人类疾病、健康与健康生活的转化和临床问题，也可容纳具有明确临床转化方向的生物医学研究。研究领域不设固定清单，而由学生问题、导师专长、临床环境、设备与经费共同决定。申请前必须取得医学院教师的导师同意，且导师须具备支持拟议项目和学生资助的资金。
项目重视把科学问题连接到可以改善理解、诊断、干预、康复、服务或健康结果的证据，但研究学位本身不等于临床执业训练。学生可能使用实验室样本、临床记录、患者报告、影像、生理测量、康复表现、队列资料或计算方法，具体取决于获批课题。每项研究都应预先界定人群、暴露或干预、比较、结果、时间范围和可行性，说明观察性关联与因果结论的差别，并规划伦理审批、隐私保护、生物安全、样本治理和临床风险升级程序。
学位要求至少九学分研究生课程，由咨询委员会选择并经研究生项目负责人批准；学生持续注册HSC 994论文研究并完成HSC 990健康科学研究生研讨。没有既往生物统计训练的人会被强烈建议修读相关课程，例如CHEP 805，该课程可计入或超过最低学分。最终须撰写并成功答辩M.Sc.论文。课程量只是最低要求，论文质量取决于问题、设计、资料完整性、分析、可复现性、临床意义与对局限的准确陈述。
导师最低承诺资助为每年一万八千加元、连续两年，有限的奖学金、研究奖助和助教机会竞争激烈，且通常只能在录取后申请。资助承诺应由导师和学生确认来源、期限、里程碑及工作责任，不能与毕业后工资混淆。毕业生可进入临床研究、健康研究协调、生物医学研究、数据与方法支持、政府或产业研究，也可申请博士；但学位不会自动授予医疗、治疗、实验室或受监管研究岗位的执照。需要临床接触、试验职责或受控资料访问的岗位仍会要求组织培训、专业资质和监督。学生还应在项目开始时确认临床合作方、资料所有者、实验室支持和统计资源的实际可用性，并为招募延误、样本损失、设备停机、资料权限改变及阴性结果预留替代方案，使两年计划能够在不牺牲伦理与证据质量的情况下完成。
